生物化學家和分子生物學家使用電泳儀來分離大分子，例如蛋白質和核酸。這使科學家能夠分離和分析復雜混合物中的單個蛋白質或核酸序列。實驗室中電泳的一個典型例子是微生物學家，使用聚合酶鏈反應（PCR）分離微生物群落中產生的DNA片段。無論目的如何，電泳儀始終需要使用緩沖液。

電泳根據分子的大小，電荷或其他特性沿梯度將其分離。該梯度可以是電場，或者在變性梯度凝膠電泳（DGGE）的情況下，可以是變性劑，例如尿素和甲酰胺的混合物。如果帶負電荷，蛋白質將向陽極遷移，如果帶正電荷，則蛋白質將向陰極遷移。由于大分子的遷移要比小分子慢，因此科學家可以測量行進的距離并使用對數確定碎片的大小。

借助DGGE，DNA沿著變性能力增強的梯度移動，直到該能力足以使特定的DNA片段完全變性或展開。此時，遷移停止。科學家可以使用這種方法根據片段對變性的敏感性來分離片段。

在電泳基于電荷分離的情況下，緩沖液中的離子會傳輸分離所需的電荷。通過提供弱酸和弱堿的緩沖液，緩沖液還將pH值保持在狹窄的范圍內。這很重要，因為蛋白質或核酸的結構和電荷在pH發生明顯變化時會發生變化，從而阻止了正確的分離。

對于將電泳凝膠維持在不同的所需pH范圍，不同的緩沖液是理想的?？茖W家為此目的使用的典型緩沖液包括乙酸，硼酸，磷酸和檸檬酸以及甘氨酸和牛磺酸。通常，pKa值（酸解離常數）應接近所需的pH。對于我們而言，最好提供低電荷量的緩沖器，以免傳導過多電流。