進行瓊脂糖凝膠電泳所需的設備和用品相對簡單，包括：

1. 電泳儀和電源
2. 凝膠澆鑄托盤，有各種尺寸，由紫外線透明塑料制成。在澆鑄凝膠時，用膠帶封閉托盤的開口端，然后在電泳之前將其除去。
3. 樣品梳子，將熔融的介質倒在梳子周圍，??以在凝膠中形成樣品孔。
4. 電泳緩沖液，通常是Tris-acetate-EDTA（TAE）或Tris-borate-EDTA（TBE）。
5. 上樣緩沖液，其中包含一些稠密的物質（例如甘油）以使樣品“掉入”樣品孔，以及一種或兩種跟蹤染料，它們在凝膠中遷移并可以進行可視監控或電泳進行了多遠。
6. 染色：當在非本征氟乙錠存在下進行電泳時，在紫外燈下很容易觀察到DNA分子。或者，可以在電泳分離后通過將凝膠浸入溴化乙錠溶液中對核酸染色。當插入雙鏈DNA中時，該分子的熒光大大增加。也可以用外部氟1-苯胺基-8-萘磺酸鹽檢測DNA。
7. Transilluminator（紫外線燈箱），用于可視化凝膠中的染色DNA。